Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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