Protein–RNA interactions for Protein: P62932

Fbxo40, F-box only protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo40P62932 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo40P62932 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms