Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab3cP62823 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rab3cP62823 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rab3cP62823 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab3cP62823 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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