Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vsnl1P62761 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsnl1P62761 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms