Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbpl1P62340 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbpl1P62340 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms