Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Itga11P61622 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga11P61622 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms