Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme3P61290 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psme3P61290 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Psme3P61290 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms