Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf3P61205 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf3P61205 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms