Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actr1aP61164 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actr1aP61164 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms