Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms