Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab5bP61021 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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