Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sem1P60897 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sem1P60897 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms