Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ppfia3P60469 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppfia3P60469 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms