Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Setd4P58467 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd4P58467 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms