Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcbp4P57724 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp4P57724 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp4P57724 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp4P57724 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp4P57724 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp4P57724 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp4P57724 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp4P57724 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp4P57724 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp4P57724 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcbp4P57724 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp4P57724 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp4P57724 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcbp4P57724 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms