Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp25P57080 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp25P57080 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp25P57080 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Usp25P57080 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Usp25P57080 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Usp25P57080 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Usp25P57080 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Usp25P57080 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp25P57080 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp25P57080 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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