Protein–RNA interactions for Protein: P56501

Ucp3, Mitochondrial uncoupling protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ucp3P56501 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ucp3P56501 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ucp3P56501 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ucp3P56501 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ucp3P56501 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ucp3P56501 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ucp3P56501 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ucp3P56501 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ucp3P56501 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ucp3P56501 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ucp3P56501 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ucp3P56501 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ucp3P56501 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms