Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1P56183 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp1P56183 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms