Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh5P55284 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh5P55284 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms