Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms