Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcd3P55096 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd3P55096 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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