Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aqp4P55088 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms