Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PitpnbP53811 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms