Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HccsP53702 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HccsP53702 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HccsP53702 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HccsP53702 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HccsP53702 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HccsP53702 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HccsP53702 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HccsP53702 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms