Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apobec1P51908 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apobec1P51908 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms