Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod1P49813 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms