Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms