Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcd1P48410 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms