Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VdrP48281 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VdrP48281 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VdrP48281 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VdrP48281 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms