Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrprbP47758 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms