Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zic1P46684 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zic1P46684 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms