Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sipa1P46062 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sipa1P46062 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sipa1P46062 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sipa1P46062 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sipa1P46062 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sipa1P46062 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sipa1P46062 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sipa1P46062 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sipa1P46062 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sipa1P46062 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sipa1P46062 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms