Protein–RNA interactions for Protein: P43688

Nkx2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-6P43688 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-6P43688 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms