Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmx2P43687 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx2P43687 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms