Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PtgfrP43117 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtgfrP43117 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms