Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms