Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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