Protein–RNA interactions for Protein: P41158

Elk4, ETS domain-containing protein Elk-4, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk4P41158 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elk4P41158 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elk4P41158 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elk4P41158 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elk4P41158 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elk4P41158 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elk4P41158 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elk4P41158 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elk4P41158 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elk4P41158 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elk4P41158 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elk4P41158 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elk4P41158 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elk4P41158 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Elk4P41158 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elk4P41158 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Elk4P41158 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Elk4P41158 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Elk4P41158 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elk4P41158 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms