Protein–RNA interactions for Protein: P40645

Sox6, Transcription factor SOX-6, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox6P40645 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sox6P40645 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox6P40645 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms