Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TfamP40630 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TfamP40630 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TfamP40630 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TfamP40630 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms