Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms