Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps26aP40336 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms