Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fen1P39749 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fen1P39749 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fen1P39749 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fen1P39749 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fen1P39749 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fen1P39749 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fen1P39749 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms