Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lig1P37913 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig1P37913 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms