Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprkP35822 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprkP35822 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprkP35822 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprkP35822 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprkP35822 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprkP35822 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
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