Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rfc1P35601 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rfc1P35601 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms