Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms