Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpardP35396 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpardP35396 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpardP35396 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpardP35396 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms