Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc1P34928 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc1P34928 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms