Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2aP34056 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms