Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms